Quorum sensing in Escherıcıa coli'de antimikrobiyal direncinden sorumlu mutasyonların oluşumundaki rolünün araştırılması

dc.contributor.advisorEngin, Evren Doruk
dc.contributor.authorÖztürk, Aslınur Gülnaz
dc.contributor.departmentOthertr_TR
dc.date.accessioned2022-06-29T07:35:58Z
dc.date.available2022-06-29T07:35:58Z
dc.date.issued2014
dc.description.ozetBakterilerde antibiyotik direnci hem tıbbi açıdan ciddi bir sorun teşkil etmekte, hem de biyoteknoloji alanında dikkatleri üzerine çekmektedir. Bakteriler antibiyotiklere antibiyotiğin kimyasal yapısını bozacak enzimler üreterek, hücreye giren antibiyotikleri aktif bölgelere ulaşmadan hücre dışına çıkararak ve stratejik nokta mutasyonları oluşturup antimikrobiyallerin işleyiş mekanizmalarını engelleyerek direnebilmektedir. Günümüzde kullanılan antibiyotikler bakteriyel enfeksiyonların tedavilerinde yeterli olamamakta ve bakterilerin çoklu ilaç direnci geliştirmelerine neden olmaktadır. Bu nedenle bakterilerin antibiyotik direncini sınırlandırabilmek için biyoteknoloji alnında alternatif yöntemler düşünülmektedir. "Quorum sensing", bakteri hücrelerinin hücreye nüfuz edebilen otoindükleyici (Oİ) adlı küçük sinyal molekülleriyle gerçekleştirdikleri iletişim mekanizmasıdır. Bu mekanizmanın bakterilerin popülasyon yoğunluğunu ve çoğalma, biyofilm oluşturma ve çeşitli sekonder metabolitler oluşturma gibi aktivitelerinin düzenlenmesinde rol aldığı bilinmektedir. Bakterilerin antimikrobiyal direnç geliştirmesi, gerekli mutasyonları geçirebilecek bakterinin kendi metabolik aktivitelerini azaltarak dış dünyayla alışverişini sınırlayıp antimikrobiyallerin zararlı etkilerinden korunaklı hale gelmesiyle mümkün olmaktadır. Bu tez kapsamında, Escherichia coli'de "quorum sensing" mekanizmasının antimikrobiyal stresi altındaki bakteride dirençli fenotipe geçişteki etkisi, E. coli suşlarından "quorum sensing" molekülü S-adenozil homosistein (SAH) üretebilen JM109 ve SAH üretemeyen DH5α ΔluxS kullanılarak incelenmiştir. JM109 ve DH5α ΔluxS suşları Minimum İnhibitör Konsantrasyon (MİK) testi ile artan değerlerde siprofloksasine maruz bırakılıp gyrA ve parC genlerinde nokta mutasyonların oluşumu tetiklenerek incelenmiştir. JM109 suşunun antimikrobiyal stresi altında daha hızlı nokta mutasyonu yapabildiği gözlemi üzerine "quorum sensing" mekanizmasının antimikrobiyal direnci kazanımındaki rolü, otoindükleyici-2 (Oİ-2) ifadelenmesi ve düzenlenmesinden sorumlu luxS'in DH5α ΔluxS suşuna klonlamayla komplementasyon yapılarak bu izogenik mutantın antimikrobiyal stresi altında dirençli fenotipe geçiş davranışı incelenmiştir. Oluşturulan mutant suşların Oİ-2 üretebilme kapasitesi Photobacterium phosphoreum suşundaki biyolüminesansın baz alındığı biyolojik tayin yöntemiyle de gösterilmiştir. luxS komplementasyonu sonucu mutant DH5α'nın kontrol suşlara göre yüksek dozda siprofloksasin maruziyetinde daha fazla koloni oluşturması, "quorum sensing"in bakterilerde antimikrobiyal stres altında persistan fenotipe geçişte önemli rol oynadığını fizyolojik olarak göstermiştir.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12575/82421
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherBiyoteknoloji Enstitüsütr_TR
dc.subjectQuorum sensing in Escherıcıa colitr_TR
dc.subjectMikrobiyolojitr_TR
dc.subjectBakterilertr_TR
dc.titleQuorum sensing in Escherıcıa coli'de antimikrobiyal direncinden sorumlu mutasyonların oluşumundaki rolünün araştırılmasıtr_TR
dc.typemasterThesistr_TR

Files

Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
No Thumbnail Available
Name:
378029.pdf
Size:
1.34 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
No Thumbnail Available
Name:
378029.pdf
Size:
1.34 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.62 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: