Browsing by Author "YAVUZCAN, Hijran (Tez Danışmanı)"

Now showing 1 - 2 of 2
  • No Thumbnail Available
    Item
    Lactococcus garvieae ile enfekte edilen tilapia balıklarında (Oreochromis niloticus L.) plazma lizozim aktivitesinin belirlenmesi
    (Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Su Ürünleri Anabilim Dalı) YAVUZCAN, Hijran (Tez Danışmanı); SEÇER, Faik Sertel (Yazar)
    Bu çalışmada Tilapia balıklarında (Oreochromis niloticus L.) Gram pozitif bir bakteri olan Lactococcus garvieae`nınsublethal dozda non-spesifik bağışık yanıtın önemli parametrelerinden plazma lizozim aktivitesi ve hematokrit değereetkisi değerlendirilmiştir. Bu parametreler; i) L.garvieae ile intraperitonal enjeksiyonla sublethal dozda deneyselolarak enfekte edilen balıklarda (Grup L); ii) deneysel olarak enfekte edilen balıklarla birlikte kohabitasyona bırakılanbalıklarda (Grup LK); iii) PBS verilen kontrol grubu balıklarında (Grup P) ve iv) herhangi bir işleme tabi tutulmayankontrol grubu balıklarda (Grup PK) ölçülmüştür. Deneysel enfeksiyon L.garvieae`nın intraperitonal enjeksiyonu ilegerçekleştirilmiştir. L.garvieae'nın tilapia balıklarındaki LC50 değeri Kärber metoduna göre 1x1010kob/ml olaraksaptanmıştır. Sublethal doz 1x109kob/ml intraperitonal (i.p) olarak uygulanmıştır. Kontrol grubuna aynı miktarda PBSi.p olarak verilmiştir. Örnekleme, enjeksiyonu takiben 3., 5. ve 7. günlerde yapılmıştır. Plazma lizozim aktivitesi GrupL balıklarında günlere bağlı olarak değişim göstermiştir (P<0,05); 3. günde 11,5 ± 3,03 U/ml; 5. günde 19,3 ± 3,83U/ml; 7. günde 6,1 ± 0,949 U/ml olarak ölçülmüştür. Plazma lizozim aktivitesi Grup LK balıklarında günlere bağlıolarak değişim göstermiştir (P<0,05); 3. günde 17,4 ± 2,83 U/ml; 5. günde 7,4 ± 1,54 U/ml; 7. günde 8,1 ± 2,67 U/mlolarak ölçülmüştür. Plazma lizozim aktivitesi Grup P balıklarında günlere bağlı olarak değişim göstermiştir (P<0,05);3. günde 14,6 ± 4,86 U/ml; 5. günde 21,0 ± 9,30 U/ml; 7. günde 9,8 ± 1,53 U/ml olarak ölçülmüştür. Plazma lizozimaktivitesi Grup PK balıklarında günlere bağlı olarak değişim göstermiştir (P<0,05); 3. günde 9,2 ± 1,32 U/ml; 5. günde5,8 ± 1,86 U/ml; 7. günde 7,6 ± 1,29 U/ml olarak ölçülmüştür. Hematokrit değeri Grup L balıklarında günlere bağlıolarak değişim göstermiştir (P<0,001); 3. günde % 21,20 ± 0,50; 5. günde % 18,24 ± 0,80; 7. günde % 10,59 ± 0,83olarak ölçülmüştür. Hematokrit değeri Grup LK balıklarında günlere bağlı olarak değişim göstermiştir (P<0,001); 3.günde % 22,64 ± 0,46; 5. günde % 18,88 ± 0,53; 7. günde % 12,14 ± 0,66 olarak ölçülmüştür. Hematokrit değeri GrupP ve Grup PK balıklarında günlere bağlı olarak değişim göstermiştir (P<0,001); Grup P balıklarında 3. günde % 22,42± 0,50; 5. günde % 13,84 ±0,45; 7. günde % 11,54 ± 0,49 olarak ölçülmüştür. Hematokrit değeri Grup PK balıklarında3. günde % 22,13 ± 0,68; 5. günde % 19,92 ± 0,52; 7. günde % 14,37 ± 0,45 olarak ölçülmüştür. Tilapia balıklarındaL.garvieae'nın horizontal bulaşma potansiyeli bulunmaktadır. Ancak plazma lizozim aktivitesi, L.garvieae ile enfektetilapia balıklarında sabit bir değişim göstermemiştir. abstractIn this study the plasma lysozyme activity, as an indicator of non-spesific immune response, and hematocrit value wereevaluated in tilapia (Oreochromis niloticus L.) experimentally infected with Gram positive bacterium Lactococcusgarvieae at a sublethal dose. Plasma lysozyme activity and hematocrit value were measured in fish; i) experimentallyinfected fish via intraperitonally injection of L.garvieae at a sublethal dose (Group L); ii) cohabitated fish withexperimentally infected fish (Group LK); iii) control fish injected with PBS (Group P) and iv) control fish without anyapplication (Group PK). Experimental infection were carried out by intraperitonally injection of L.garvieae. LC50value of L.garvieae assessed acccording to Kärber is 1x1010cfu/ml. For the experimental infection sublethal dose of1x109cfu/ml was injected by intraperitonally. PBS was given to the control group at the same volume. Sampling wasmade at 3rd, 5th and 7th days after challenge. Plasma lysozyme activity in Group L change during the experiment days(P<0.05). Plasma lysozyme activity values in Group L was measured as 11.5 ± 3.03 U/ml in the 3rd day; 19.3 ± 3.83U/ml in the 5th day and 6.1 ± 0.95 U/ml in the 7th day. Plasma lysozyme activity in Group LK was decreased duringthe sampling days (P<0.05). Plasma lysozyme activity values in Group LK was measured as 17.4 ± 2.83 U/ml in the3rd day; 7.4 ± 1.54 U/ml in the 5th and 8.1 ± 2.67 U/ml in the 7th day. Plasma lysozyme activity in Group P wasdecreased during the experiment days (P<0.05). Plasma lysozyme activity values in Group P was measured as 14.6 ±4.86 U/ml in the 3rd day; 21.0 ± 9.30 U/ml in the 5th and 9.8 ± 1.53 U/ml in the 7th day. Plasma lysozyme activity inGroup PK increased depending on sampling days (P<0.05). Plasma lysozyme activity values in Group PK wasmeasured as 9.2 ± 1.32 U/ml in the 3rd day; 5.8 ± 1.86 U/ml in the 5th and 7.6 ± 1.29U/ml in the 7th day. Hematocritvalues in Group L was decreased during the sampling days days (P<0.001). Hematocrit values in Group L wasmeasured as 21.20 ± 0.50% in the 3rd; 18.24 ± 0.80% in the 5th and 10.59 ± 0.83% in the 7th day. Hematocrit values inGroup LK was decreased during the experiment days (P<0.001). Hematocrit values in Group LK was measured as22.64 ± 0.46% in the 3rd; in the 5th 18.88 ± 0.53% and 12.14 ± 0.66% in the 7th day. Hematocrit values in Group P andGroup PK were decreased depending on sampling days (P<0.001). Hematocrit values in Group P was measured as22.42 ± 0.50% in the 3rd; 13.84 ± 0.45% in the 5th and 11.54 ± 0.49% in the 7th day. Hematocrit values in Group PKwas measured as 22.13 ± 0.68% in the 3rd; 19.92 ± 0.52% in the 5th and 14.37 ± 0.45% in the 7th day. There is apotential of horizontal infection risk in tilapia infected with L.garvieae. However a constant change in the plasmalysozyme activity has not been detected in tilapia fish that infected with L.garvieae.
  • No Thumbnail Available
    Item
    Zostera spp. ekstraktı uygulanan Artemia larvalarına ait baskın bakteri türlerinin DNA barkodlama tekniği ile analizi
    (Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Su Ürünleri Anabilim Dalı) YAVUZCAN, Hijran (Tez Danışmanı); KAYNAR, Sevgi (Yazar)
    Çalışma kapsamında, kıyıya vurmuş Zostera spp. deniz çayırlarından elde edilen ekstraktların, Artemia larvaları üzerindeki baskın bakteri türlerine olan etkileri moleküler teknikler kullanılarak analiz edilmiştir.Ege Denizi kıyılarından toplanan Zostera spp. yapraklarından maserasyon yapılarak metanol, hekzan ve etil asetat içerikli 3 farklı ekstrakt elde edilmiştir. Hazırlanan 3 ekstraktın antimikrobiyal etkisinin ölçümü için rutin olarak kullanılan bakteri suşları ile ekstraktların MIC (en düşük önleyici konsantrasyon) değerleri hesaplanmıştır. Ticari olarak temin edilen Artemia kistleri hazırlanan yapay steril deniz suyunda (YSDS) 48 saatlik inkübasyona bırakılmıştır. Tespit edilen ekstrakt değerleri kistlerden çıkan Artemia larvalarına uygulanmış ve canlıların yaşama oranı hesaplanmıştır. Mortalite deneyleri, metanol ve etil asetat ile çözdürülmüş 2 ekstraktın Artemia larva çalışmalarına uygun olduğunu göstermiştir. Analizler doğrultusunda 2 ekstraktın ayrı ayrı uygulandığı ve herhangi bir maddeye maruz bırakılmayan larvaların bulunduğu 3 farklı deney düzeneği oluşturulmuştur. Deney sistemi 24 saatlik inkübasyona bırakılmış ve larvalardan direkt olarak DNA izolasyonu yapılmıştır. Aynı zamanda kontrol amaçlı olarak, hazırlanan YSDS filtre edilmiş ve kontaminasyon tespiti için filtreden DNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. DNA izolatlarından bakteriyel 16S rRNA geni ve içerdiği V4 bölgesi nested PCR tekniği ile çoğaltılmış ve dizi analizinden tür teşhisine gidilmiştir.Uygulamalar sonunda gerçekleştirilen moleküler analizler sonucunda, YSDS’nin kontamine olmadığı, kontrol grubundaki larvaların mikrobiyotasındaki baskın bakteri türü Bacillus litoralis iken metanol ile çözdürülen Zostera spp. ekstrakt uygulamaları sonrasında ise kültüre edilemeyen Bacteroides sp. türü olduğu tespit edilmiştir.AbstractThe aim of this study was analyse to the dominant bacterial species from Artemia nauplii treated with extracts from seagrass (Zostera spp.) detritus.leaves of Zostera spp. were collected from coastal area of Aegen sea and three different extract was prepared using organic solvents (methanol, ethyl acetate and hexane). Extract’s MIC (Minimal Inhibitory Concentration ) values was calculted using the standart bacterial strains. Artemia cycts were obtained commercially and hatched in artifical streril sea water (ASSW). After the 48 h nauplii were harvested exposure to extracts then lethality of Artemia nauplii were assessed. Mortality experiment indicate that methanol and ethyl acetate extracts were suitable for Artemia nauplii study. In the direction of analysis two extracts was applied Artemia nauplii. After the 24 h incubation DNA was isolated from Artemia nauplii of natural culture and teo axtract application. As contamination analyses of ASSW water was filtered and DNA was isolated from filter membran. 16S rRNA and V4 region of DNA extract were amplified with nested PCR using bacteria specific primers and squence analyses were performed.Molecular analysis indicated that Bacillus litoralis is the dominant bacterial species in natural microbiota of Artemia naupliii and uncultured Bacteroides sp. was identified as the dominant bacteria strain of methanol applied group.