TÜRKİYE’DEN HALOFİLİK ARKEBAKTERİLERİN İZOLASYONU VE KARAKTERİZASYONU
Göster/ Aç
Yazar
ÖZCAN, Birgül (Yazar)
ÇÖKMÜŞ, Cumhur (Tez Danışmanı)
Üst veri
Tüm öğe kaydını gösterÖzet
Tuz gölü (Ankara), Acı göl (Denizli), Salda gölü (Burdur), Seyfe gölü (Kırşehir), Tuzla gölü (Kayseri) ve Bolluk gölü (Konya) olmak üzere Türkiye'nin altı farklı tuzlu bölgesinden toplanan toprak, su ve tuz kütlesi örneklerinden %25 (w/v) NaCl içeren kompleks besi yeri kullanılarak 95 adet halofilik arke izole edilmiştir. Antibiyotik duyarlılığı ve zar-eter lipit analizleri ile arke olarak tanımlanan izolatlar, hareket, pigmentasyon, Gram reaksiyonları, koloni ve hücre morfolojisi, biyokimyasal testler, elektroforetik protein profilleri ve plazmid içerikleri yönünden incelenmiştir. Buna göre izolatların %83.2'sinin hareketli, %96.8'inin Gram (-), %62'sinin çubuk ve %19'unun pleomorfik hücre morfolojisine sahip olduğu görülmüştür. İzolatların, genelde yuvarlak, düz kenarlı, konveks koloni morfolojisine sahip oldukları ve açık pembeden kırmızıya kadar değişen renk tonlarında pigmentasyon gösterdikleri bulunmuştur. Çeşitli biyokimyasal testler sonucunda halofilik arke izolatlarının tümünün katalaz ve oksidaz aktivitesine ve sadece 2 izolatın L-arjininde anaerobik üreme yeteneğine sahip oldukları tespit edilmiştir. Bunların dışındaki biyokimyasal testlerde %85.3-2.1 aralığında pozitif sonuçlar elde edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testi sonucuna göre tüm izolatların bazitrasin, novobiyosin ve rifampisin'e duyarlı oldukları saptanmıştır. İzolatlardan 60'nın 1-6 arasında değişen sayıda ve 1.0-36.9 kb arasında değişen farklı moleküler büyüklüklerde plazmid içerdikleri belirlenmiştir. Ayrıca izolatların tüm hücre protein profilleri SDS-PAGE ile çıkarılarak MVSP analiz programı ve UPGMA metodu kullanılarak karşılaştırılmış, benzerlik dendogramı çıkarılmıştır. Buna göre izolatlar 8 gruba ayrılmış, 10 adet izolatın standart suşlarla birlikte tek bir grup içinde toplandıkları ve bu grup içerisinde 4 izolatın diğerleri farklı gruplar oluşturduğu halde standart suşlara benzerlik oranlarının yüksek olduğu görülmüştür.