Aerıbacıllus Sp. A364 Suşunun Genomik Düzeyde Fonksiyonel Anotasyonuve Endüstriyel Sekonder Metabolit Potansiyelinin In Sılıco Analizi

Abstract

Termofilik bakteriler, sahip oldukları metabolik çeşitlilik ve yüksek sıcaklıklara dayanıklı enzimleri sayesinde endüstriyel ve biyoteknolojik uygulamalarda önemli bir potansiyele sahiptir. Bu çalışmada, Aeribacillus sp. A364 izolatının tür düzeyinde tanımlanması ve fonksiyonel genomik kapasitesinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Öncelikle, izolatın tür teşhisi 16S rRNA gen analizi ile yapılmış ve Aeribacillus composti A364 olarak belirlenmiştir. Ardından filogenomik analizler gerçekleştirilmiş; ortalama nükleotit benzerliği (ANI), dijital DNA–DNA hibritizasyonu (dDDH), ortalama amino asit benzerliği (AAI) ve korunan protein yüzdesi (POCP) hesaplanarak filogenetik konumu ortaya konmuştur. Hibrit genom dizileme stratejisi ile elde edilen veriler de novo montaj sonrası anotasyon sürecine alınmış ve genom bütünlüğü ile kalite kontrol analizleri yapılmıştır. Ayrıca A364 genomu, A. composti KCTC 33824T, Aeribacillus pallidus KCTC 3564T ve Halolactibacillus halophilus DSM 17073T ile karşılaştırmalı olarak incelenmiştir. Elde edilen bulgular, A364 izolatının antimikrobiyal peptit, terpenoid ve vitamin biyosentez yollarını içeren genetik kapasiteye sahip olduğunu göstermiştir. Özellikle B1, B2, biyotin, piridoksal-P ve molibdopterin kofaktörü (Moco) biyosentezine ilişkin genlerin varlığı, bu bakterinin biyoteknolojik açıdan değerli metabolitler üretebilme potansiyelini ortaya koymuştur. Sonuç olarak, A. composti A364 izolatı; biyoremediasyon, endüstriyel enzim üretimi ve yeni biyolojik aktif bileşiklerin keşfi açısından umut vadeden bir mikroorganizma olarak değerlendirilmektedir.