Türkiye’de yayılış gösteren bazı Lecidea liken türlerinin rDNA ITS bölgelerinin dizi analizi yöntemi ile tanımlanması

Abstract

Bu çalışma; ülkemizde yayılış gösteren Lecidea ve ilişkili liken cinslerinden olan Lecidella, Porpidia ve Rhizocarpon cinslerine ait bazı türlerin, rDNA (ITS) bölgelerinin, ITS 1F ileri ve ITS 4 geri primerleri kullanılarak PZR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yardımıyla çoğaltılması, ilgili bölgenin dizi analizi ile incelenmesi ve incelenen türler arasındaki benzerlik ve farklılıkların ortaya çıkartılması amacıyla yapılmıştır. Çalışılan türler ve Gen Bankasından dizileri alınan Lecidea, Lecidella ve Rhizocarpon cinslerine ait örnekler arasındaki genetik yakınlığı bulmak için oluşturulan dört farklı metot ile (UPGMA, NJ, ME, MP) filogenetik analizler yapılmıştır. Tüm filogenetik analizler sonucu elde edilen genetik ilişkiler, birbirine benzer şekilde ortaya çıkmıştır. Neighbor-Joining dendrogramı incelendiğinde, türlerin başlangıçta iki ana kola ayrıldığı, grup dışı olarak alınan tür bir kolu oluştururken, diğer türlerin ikinci kolda toplandığı gözlenmiştir. İkinci kol kendi içinde ikili dallanmalar göstermektedir. Genel olarak, aynı cinse ait türler, köke doğru tek bir dal üzerinde birleşmektedir.